信用卡自动还款只还了一部分，最大的可能是银行卡里面余额不够，比如你的信用卡账单是5000元，但是用来还款的银行卡里面只有3000元，那么最多就只能还款3000元，还有2000元的额度需要持卡人及时的充值还款的。
信用卡自动还款一般是建立在持卡人同意的基础上，比如办理信用卡之后，签署了自动还款的协议，一般是发卡银行从该用户在本行的银行卡里面扣除，比如你的招商银行信用卡到了还款日系统会从你的招商银行卡里面扣钱还款。
若是发现自己的信用卡额度只还了一部分，赶紧手动还款，若是还款资金不够，可以申请最低还款，最低还款是指在到期还款日前，按照账单的最低金额还款，不会产生滞纳金，也不会影响个人信用，但会产生循环利息，当期的所有消费将从记账日(一般是消费后的第二天)开始计收利息，日息万分之五，直至全部还清为止。
信用卡自动还款可以有效的避免因为忘记还款而造成逾期，但是要注意每一期是否全额还款了。
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